Отделение эндоскопии оснащено самой современной эндоскопической аппаратурой японских фирм «PENTAX», «OLYMPUS» и «KARL STORZ». Почти все эндоскопические методики в отделе эндоскопии проводятся в составе сложных медицинских услуг (СМУ), что позволяет объединить работу анестезиологов, проводящих анестезию при исследовании и (или) патоморфологов, исследующих биопсийный материал.