Отделение эндоскопии определяется как вспомогательное хирургическое подразделение стационара, где проводится исследования «полых» внутренних органов: желудка, легких, толстого кишечника и почек и других органов с помощью эндоскопической аппаратуры (гастродуоденоскопия, бронхоскопия, колоноскопия, цистоскопия и др.).